Genómica

Soluciones completas, desde el diseño experimental hasta el análisis estadístico y la interpretación de los resultados

La Plataforma de Genómica ofrece una amplia gama de servicios científicos a grupos de investigación, hospitales, empresas y laboratorios públicos y privados. Además colabora en proyectos de investigación científica y sirve de punto de encuentro entre el desarrollo científico del ámbito universitario y público y la demanda tecnológica del sector privado.

  • Equipo experto y profesional altamente cualificado
  • Tecnologías y equipamientos innovadores
  • 15+ años de experiencia
  • 11+ años de especialización en secuenciación masiva
  • 100+ grupos de investigación atendidos cada año
  • 60 000+ muestras analizadas cada año
  • 350+ proyectos atendidos cada año

Servicios

Soluciones completas adecuadas a cada proyecto, desde el diseño experimental hasta el análisis estadístico y la interpretación bioinformática de los resultados obtenidos

Secuenciación masiva (NGS)
  • Secuenciación de DNA: de novo / re- secuenciación / secuenciación dirigida
  • Secuenciación de RNA y smallRNA: transcriptómica / expresión génica
  • Metagenómica: análisis globales de poblaciones / secuenciación de amplicones 16S / ITSs / 18S
Secuenciación de célula única (single cell)
  • Preparación de librerías Chromium
  • Preparación de librerías Visium

 

 

 

PCR a tiempo real (qPCR)
  • Estudios de expresión génica
  • Análisis de expresión de microRNAs
  • Genotipado con sondas Taqman
  • Análisis estadísticos basados en software Statminer®
PCR digital (dPCR)
  • Detección de mutaciones raras.
  • Análisis de variación en el número de copias (CNVs)

 

 

BioAnalizador (BA)
  • Análisis de RNA total o fracciones de RNA, medida de RIN
  • Análisis de DNA: determinación de perfiles electroforéticos y estimación de concentraciones
Cuantificación DNA/RNA (PG-RG)
  • Medida fluorimétrica (PicoGreen/ RiboGreen)
  • Cuantificación de DNA basada en fluorimetría (PicoGreen)
  • Cuantificación de DNA y RNA mediante espectrofotometría (nanoDrop)

Solicitudes

Información básica sobre Protección de Datos.

Responsable: Fundación Parque Científico de Madrid. – CIF G-83077891
Finalidad: Gestionar la relación comercial con usted.
Legitimación: Al usar sus datos nos basamos en el consentimiento que nos da al ponerse en contacto con nosotros.
Destinatarios: Salvo obligaciones contractuales o judiciales, no están previstas las comunicaciones de datos a otras entidades.
Derechos: Acceder, rectificar y suprimir los datos, así como otros derechos, como se explica en la información adicional.
Información adicional: Puede consultar la información adicional y detallada sobre Protección de Datos en nuestra Política de privacidad.

Publicaciones

Artículos científicos en los que ha participado la Plataforma de Genómica
 
Autores Año Revista Tema PDF
Wesselink et al. 2012 J. Bacteriol. Secuencia genómica de Klebsiella pneumoniae OXA-48
Singh et al. 2013 PLOS Genetics Movilidad de Bacillus subtilis por conjugación plasmídica
Fernández et al. 2018 Oncotarget Genes relacionados con lípidos en cáncer de colon
Lanza et al. 2018 Microbiome Análisis del resistoma en muestras metagenómicas
López-Camacho et al. 2018 J. Global Antimicrobial Resistance Estructura poblacional de un brote de Klebsiella pneumoniae
Bravo-Alonso et al. 2019 J. Clin. Medicine Variantes genéticas asociadas a acidosis láctica
Prieto-Potín et al. 2020 Peer J. Validación de un panel de genes en cáncer
Schoorlemmer et al. 2020 Epigenomics Metilación de ADN en parto pre-término
Trilla-Fuertes et al. 2020 Mol. Cell Proteomics Genómica y Proteómica en carcinoma anal
Trilla-Fuertes et al. 2020 Transl. Oncology Visión general de mutaciones presentes en carcinoma anal
Trilla-Fuertes et al. 2021 Sci. Reports Variantes genéticas en pacientes de carcinoma anal tratados con Panitumumab
Herreros-Villanueva et al. 2022 Gastroenterología y Hepatología Mutaciones en plasma de pacientes con cáncer de páncreas Enlace al artículo original de Herreros-Villanueva et al. (2022)
Trilla-Fuertes et al. 2023 Int. J. Molecular Sc. Predicción de la respuesta a terapia anti-PD1 en pacientes de carcinoma anal
Trilla-Fuertes et al. 2023 Cancer Biomarcador para el diagnóstico de carcinoma anal
Trilla-Fuertes et al. 2023 Cancers Respuesta a inhibidores de PD-1 en melanomas avanzados
Fdez. de las Peñas et al. 2024 Biomedicines Dolor post COVID-19 y cambios en el patrón de metilación del ADN
García-Tenorio et al. 2025 Human Cell Desactivación génica para acidemia propiónica mediante CRISPR-Cas9
Autores Año Revista Tema PDF
Fierro-Fernández et al. 2015 EMBO Reports Supresión de fibrosis mediante miR-9-5p
Doncel-Pérez et al. 2016 J. Immunol. EGR2 en syndrome Gullian-Barré
Herrera et al. 2018 Molecular Cancer ARN exosomal no codificante en cáncer colorrectal
Llorens et al. 2018 BMC Genomics Patrones de expresión génica de Anisakis
Alonso-Hearn et al. 2019 Sci. Reports Señalización de CXCL8 en ganado infectado con Mycobacterium
Fierro-Fernández et al. 2019 FASEB J. Regulación de ARN mediante miR-9-5p en fibrosis renal
Díaz et al. 2020 Int. J. Mol. Sciences miR-7641 en vasculopatía hialinizante
Llorens et al. 2020 Clin. Oral Invest. Perfil de expresión de ARN en leucoplasia proliferativa
Puente-Santamaría et al. 2021 bioRxiv Búsqueda de patrones de transcripción en hipoxia Enlace al artículo original de Puente-Santamaría et al. (2021)
López et al. 2021 Nature Genetics Secuenciación de SARS-CoV2 en España Enlace al artículo original de López et al. (2021)
Ruiz-Rodríguez et al. 2021 mBio Identificación de mutaciones en el genoma de SARS-CoV2
Martínez-González et al. 2022 Pathogens Identificación de mutaciones en SARS-CoV-2 Enlace al artículo original de Martínez-González et al. (2022)
Martínez-González et al. 2022 J. Clinical Investigation Identificación de mutaciones en SARS-CoV-2 Enlace al artículo original de Martínez-González et al. (2022)
Opazo-Ríos et al. 2022 Frontiers MicroARNs regulados en nefropatía diabética en ratones ob/ob Enlace al artículo original de Opazo-Ríos et al. (2022)
Llorens-Revull et al. 2023 Int. J. Molecular Sc. Métodos de análisis de microARNs en vesículas extracelulares Enlace al artículo original de Opazo-Ríos et al. (2022)
Badia-Bringué et al. 2024 Sci. Reports Regulación inmunológica por microARNs en vacas infectadas por Mycobacterium Enlace al artículo original de Opazo-Ríos et al. (2022)
Autores Año Revista Tema PDF
Sánchez-Diz et al. 2009 Pharmacogenics J. Polimorfismos del gen CYP2C9
Rodriguez-Sainz et al. 2010 J. Clin. Virol. Medición del c-ADN del VIH
Vargas et al. 2014 Mol. Oncology Síndrome metabólico en cáncer colorrectal
Vargas et al. 2015 Oncotarget Firma metabólica lipídica en cáncer colorrectal
Rivera-Barahona et al. 2017 Sci. Reports Expresión de microARNs en acidemia propiónica
Miguel et al. 2021 Redox Biology Expresión de microARNs en fibrosis renal
Tarancón-Díez et al. 2022 Frontiers in Immunology Perfiles de miRNAs en niños sometidos a tratamiento retroviral anti-VIH
Rey-Serra et al. 2023 Life Sci. Alliance Genes relacionados con el daño renal
Badia-Bringué et al. 2024 Scientific Reports Modulación del microARN en la paratuberculosis bovina
Glez.-Gil et al. 2024 BMC Veterinary Research Acciones proneurogénicas de la hormona folículo-estimulante
AutoresAñoRevistaTemaPDF
Robles-Vera et al.2019NutrientsImpacto de la vitamina D en el microbioma
Arcos et al.2021MicroorganismsDiversidad bacteriana en larvas de Anisakis L3

Agradecemos que, en las publicaciones que incluyan resultados obtenidos en colaboración con la Unidad de Genómica de la Fundación Parque Científico de Madrid, se cite esta participación del siguiente modo:

Agradecimientos/Acknowledgments:

Unidad de Genómica, Fundación Parque Científico de Madrid, España

Genomics Unit, Madrid Science Park Foundation, Spain

Cuando corresponda esta participación puede expresarse como:
“Datos generados mediante procedimientos normalizados establecidos.”

When appropriate, our collaboration could be described as:
“Data were generated using well-established, standardized procedures.”

Proyectos

Nombre Años Entidades participantes Tema Financiación
AgroGenDetect 2022-2024 CSIC, Plataforma Genómica FPCM, Recerca Agrícola Syntech Research Spain S.L., Microgaia Biotech S.L. Desarrollo de un sistema de detección temprana de patógenos capaces de infectar plantas de consumo Logo normativo de las entidades financiadoras del proyecto AgroGenDetect
PanCaTest 2022-2024 Advanced Marker Discovery S.L., NasasBiotech S.L., CIBER, Fund. Inv. Biomédica Hosp. Univ. Ramón y Cajal, Plataforma Genómica FPCM Desarrollo de una firma de biomarcadores en plasma útiles para el diagnóstico de cáncer de páncreas Logo normativo de las entidades financiadoras del proyecto AgroGenDetect

Divulgación

Artículos divulgativos y materiales del Museo de Genómica del Parque

AutoresAñoRevistaTemaPDF
Ramos-Ruiz2011Encuentros InterdisciplinaresGenómica
Ramos-Ruiz2013SEBMMSecuenciación genómica
Ramos-Ruiz et al.2014Comprehensive Analytical Chemistry 64 (Elsevier)Revisión de las tecnologías de genotipado
Ramos-Ruiz et al.2015Mediterráneo EconómicoLa genómica en el sector agroalimentario
Ramos-Ruiz et al.2023Estudios MultidisciplinaresLas capacidades ampliadas de los parques científicos: el caso de una unidad de genómica
DescripciónPDF
Materiales completos
Panel introductorio
Panel introductorio: ¿Qué tamaño tiene nuestro genoma? (material adicional vía QR)
Panel introductorio: Un genoma es como un libro (material adicional vía QR)
Equipo 1: ABIPRISM 3700 DNA Analyzer – el primer secuenciador totalmente automático
Equipo 1: gel de poliacrilamida (material adicional vía QR)
Equipo 2: ABIPRISM 7900 HT – un genoma, un millón de posibilidades
Equipo 2: ¿cómo funciona la PCR? (material adicional vía QR)
Equipo 2: tipos de ARN (material adicional vía QR)
Equipo 3: FLX 454 – la nueva generación de la genómica
Equipo 3: pirosecuenciación (material adicional vía QR)
Equipo 4: GAAIIx System – un equipo que llegó para quedarse
Equipo 4: secuenciación por síntesis (material adicional vía QR)