El ITH surgió de una idea: hacer converger los saberes complementarios de un creciente número de farmacólogos, hacia una actividad necesariamente pluridisciplinar: la investigación, desarrollo e innovación en el vasto campo del medicamento.
Fue la necesidad de crear un Instituto de Investigación que coordinara y potenciara las actividades de la UAM, de los Hospitales Universitarios de La Paz y La Princesa, así como las colaboraciones con grupos externos de investigadores de otras universidades, centros de investigación y empresas farmacéuticas (nacionales y extranjeros), la que favoreció que, en 2007, la Junta de Gobierno de la UAM aprobara la creación del Instituto “Teófilo Hernando” de I+D del Medicamento.